と、いうわけでどこでも取り扱ってなさそうなので書いてみます。
でも、自己責任です。
ことの始まりは友人AがMT-CARDでゲームをはじめ次はGateway3DSに移行。
両方持ってるからね。
その時セーブデータを動かしたいなんていうので少しいぢってきました。
MT-CARD → Gateway3DS
Gateway3DS → MT-CARD
というところです。
7/2 一部追記
■まずはそれぞれのセーブデータの保存場所について
MT-CARD ＝MicroSD直下
Gateway3DS ＝本体SD直下
■ファイル名
MT-CARD ＝ROMのファイル名.sav
Gateway3DS ＝TitleID.sav
TitleIDなどは http://3ds.essh.co/ から調べるといいでしょう。
上記のサイトから例として、逆転裁判5の場合
MT-CARD ＝kirin-gs5j.sav
Gateway3DS ＝00040000000BAA00.sav
です。
時間がなくて検証できなかったのは、ROM名を変更した場合
MT-CARDのセーブ名は何で作られるのか？
7/2追記＝変更したROM名でsavデータが作られました。
★まとめ
①MT-CARDからGateway3DSへ移行する場合
MicroSDにあるsavデータをTitleIDにリネームして、本体SD直下へコピー
（TitleID検索に役立つサイト http://3ds.essh.co/）
②Gateway3DSからMT-CARDへ
移行したいゲームのTitleIDを検索。
（TitleID検索に役立つサイト http://3ds.essh.co/）
本体SD直下にある目的の TitleID.sav データを確認し上記サイトの
filenameの名前.savにリネームして、
※7/2修正
ROMのファイル名に合わせて、MicroSDにコピー。
つまるところ kirin-gs5j.3ds だったら kirin-gs5j.sav ですね。
です。
一応相互は試したので大丈夫だと思いますが
うまくいかなくても責任持ちません。自己責任で。
※実際のMicroSDのフォーマット形式に注意してください。
MT-CARD ＝FAT32
Gateway3DS ＝ExFAT
バックアップを取ってフォーマットのしなおしが必要です。
本体の初期化もして、青カードからやり直しも忘れずに。
すれ違い通信の設定変更も忘れずに。